במחלקה הילדים משיגים את התפקוד הטוב ביותר ועצמאות מירבית, ועוברים הכנה להשתלבות מחודשת בבית, בביה"ס ובקהילה.
הצוות הרפואי במחלקת ילדים מיומן, קשוב ומלווה את המטופלים ואת בני משפחותיהם מהיום הראשון בשיקום. צוות המחלקה מעניק תמיכה פיזית, חינוכית ורגשית למטופל ולמשפחתו, באמצעות צוות רב-תחומי הכולל רופאים מומחים, צוות סיעודי, פיזיותרפיסטים, מרפאות בעיסוק, קלינאיות תקשורת, עובדות סוציאליות, מטפלים בתרפיה באמנות, צוות מורים לחינוך המיוחד, ופסיכולוג שיקומי. זאת, כחלק מראייה הוליסטית אשר לפיה על הצוות ללוות את הילד לאורך תקופת השיקום ולאחריה, כשמשפחתו היא חלק בלתי נפרד וחשוב ביותר בהשגת היעד.
מחלקת הילדים של המרכז הרפואי לשיקום לוינשטיין מציעה מגוון מסלולי טיפולים, אשר נותנים מענה לשלבים השונים בשיקום: אשפוז מלא במסגרת המרכז הרפואי בליווי משפחתי, כשלכל מטופל נבנית תכנית אישית המותאמת לצרכיו - אשפוז יום המציע טיפולים ברמת אינטנסיביות המותאמת לבעיות הנוירולוגיות/ תפקודיות של כל מטופל ומרפאת מעקב, הכוללת מעקב של רופא שיקום ו\או של פסיכיאטר מומחה בפגיעות ראש טראומטיות לאחר תאונות דרכים. למרפאה מוזמנים הילדים והמשפחות בהתאם לצורך, לאחר השחרור או בעקבות הפניה מרופא ילדים, נוירולוג ילדים או פסיכיאטר ילדים.
מחלקת האשפוז כוללת 18 מיטות, ושופצה לאחרונה כדי לאפשר תנאי אשפוז נוחים לילדים ומלוויהם. ההעברה ממסגרת אשפוזית לאשפוז יום מתבצעת על פי שיקולים רפואיים ושיקומיים. מחלקת הילדים נהנית מכל שירותי המרכז הרפואי לשיקום לוינשטיין, המרכז השיקומי הגדול בארץ, בעל שם עולמי שבן הריכוז הגדול ביותר של מומחים מובילים בתחומי השיקום השונים.