באחריות המחלקה לבצע את כל הרישומים, הפעולות וההליכים הקשורים בניהול מערך הכספים, ובכלל זה:
אחריות על הנהלת החשבונות והרישומים,
ניהול תקציב בית החולים, ביצוע בקרה,
ניהול הכנסות בית החולים והגבייה.
באחריות המחלקה ביצוע רישומים חשבונאיים והגשת דו"חות כספיים כמו גם דיווחים תקופתיים אחרים.
המחלקה מטפלת גם בניהול ההתקשרויות וההסכמים למול ספקי ולקוחות בית החולים, ניהול המכרזים, ביצוע תשלומים, ורישום וניהול התרומות.
מתפקידיה הנוספים של המחלקה: יעוץ כלכלי להנהלת המרכז ולמנהלי היחידות והמחלקות. תכנון עסקי והכנת תחזיות פיננסיות רב שנתיות.
ביצוע בחינות כדאיות ועבודות כלכליות להשגת התייעלות כלכלית ולניצולו האופטימאלי של התקציב.
