מחלקת העיניים משתתפת במחקרים קליניים בינלאומיים רבים של החברות המובילות בעולם כגון פייזר, רוש וכדומה, לבחינת יעילות ובטיחות של טיפולים וטכנולוגיות חדשניים – תרופות ומכשור רפואי ברפואת העיניים אשר טרם אושרו על-ידי רשויות הבריאות.
מחקר קליני הינו ניסוי רפואי המערב השתתפות של בני-אדם, כאשר ההשתתפות בניסוי הינה מרצונו החופשי של המטופל ומחייבת הסכמה מדעת. המטופל רשאי להסיר את הסכמתו בכל שלב של הטיפול. המחקרים הקליניים מפוקחים על ידי רשויות משרד הבריאות וועדות האתיקה של המרכז הרפואי מאיר, שאמונים על אבטחת זכויותיו, בטיחותו ובריאותו של כל משתתף במחקר.
יחידת המחקר כוללת צוות רופאים מומחים המובילים בתחומם, מכשור מתקדם לבדיקות הדמיה במהלך המחקר וצוות של מתאמי מחקר.