כירורגיה אורטוגנטית נועדה לתקן מיקום לקוי של עצמות הפנים והלסתות היכולים לגרום לקשיי דיבור ואכילה, כאבי פרקים, הפרעות שינה ופגמים אסתטים. במהלך הניתוח הלסתות נשברות, מובאות למקומן, ומקובעות במקומן החדש בעזרת פלטות וברגים. הניתוח מבוצע על ידי כירורגים מומחים לניתוחי פה ולסתות כאשר ברוב המקרים יש צורך בשיתוף פעולה מקדים עם רופא ליישור שיניים ולעיתים גם עם קלינאית תקשורת, דיאטנית, רופא משפחה ופסיכולוג.
תכנון הניתוח מבוצע בעזרת בדיקה קלינית, צילומי רנטגן ומודלים מגבס של השיניים. ברוב המקרים יש צורך לנתח את שני הלסתות, אך במקרים מסוימים ניתן להסתפק בניתוח חד לסתי. הניתוח עצמו מבוצע בהרדמה כללית ומצריך אשפוז של מספר ימים. ברוב המקרים יהי צורך בהכנה אורטודונטית של מספר חודשים לפני ואחרי הניתוח. למרות שניתוחים אלו מבוצעים לרוב בכדי לשפר את המראה האסתטי של הפנים ולתיקון מנשך השיניים, ניתוחים אורטוגנטים יעילים מאוד כטיפול בדום נשימה (מניסיוננו בקרוב ל100%). יש צורך בתכנון מדויק של הניתוח בכדי להבטיח שיפור מקסימלי של מעברי האוויר.