לאחר שירות של שש שנים כרופא צבאי (בתפקיד אחרון – רופא ראשי של לשכת הגיוס בחיפה בדרגת רס'ן) השלים את התמחותו במיילדות וגינקולוגיה במרכז רפואי כרמל. מאז ובמשך כעשר שנים הוא נמנה על הצוות הבכיר של המחלקה.
את עבודת מדעי היסוד במסגרת התמחותו עשה דר' ישי ביחידה הגנטית של ביה'ח מאיר בכפר סבא בשיתוף עם מחלקת נשים ויולדות של בי'ח כרמל. בהמשך השתתף במחקרים שונים ומגוונים במסגרת המחלקה ובמסגרת היחידה להפריה חוץ גופית, השתתף בכנסים בינלאומיים רבים ואף הציג עבודות בכנסים אלה.
במסגרת עבודתו כרופא בכיר במחלקה נמנה דר' ישי על צוות המנתחים שלה והוא בעל ניסיון רב בניתוחים גינקולוגיים כולל ניתוחים אנדוסקופיים (לפרוסקופיות והסטרוסקופיות). במסגרת היחידה להפריה חוץ גופית אחראי דר' ישי על ניתוחי ה TESE (ניתוחים לדגימת אשך).
