הרקמה מתקבלת למכון כשהיא נמצאת בתמיסת פורמלין השומרת על מבנה הרקמה והתאים שמרכיבים אותה , דבר המאפשר אבחנה
לאחר הכנסת הרשומה לתוכנת המחשב, הרקמה עוברת תחנה שבה מתארים את הרקמה שהתקבלה ומכניסים מדגם מייצג של הרקמה או את כל הרקמה שהתקבלה לעיבוד ארוך שמתבצע לאורך הלילה במכשיר אוטומטי. למחרת יוצקים את הרקמה לבלוק פרפין שמאפשר חיתוך של חתכים דקים באמצעות מיקרוטום. החתכים מונחים על זכוכית נושאת שמאפשרת צביעת הרקמה בצביעת המטוקסילין אאוזין (E&H) . לאחר הצביעה הסלייד מכוסה בכיסוי מיוחד שמאפשר הסתכלות במיקרוסקופ תוך שמירה על שלמות החתך.
בשלב העברת הסליידים לרופא הפתולוג כל פרטי הרשומה לרבות תיאור מאקרו נמצאים ברשומה, בתוכנת המחשב. כאשר זה אפשרי הרופא הפתולוג מוציא תשובה ללא צורך בצביעות נוספות.
חתך קפוא- FROZEN
לצורך ביצוע הבדיקה, דגימות רקמה טריה ללא פורמלין שנלקחות במהלך הניתוח נשלחות מיידית למכון ע"י סניטר. הרקמה מוקפאת לטמפרטורה של 25-50 מעלות צלסיוס שמאפשרת ביצוע חתך דק שמונח על זכוכית נושאת ונצבע בצביעה מהירה של המטוקסילין אאוזין (H&E). הסתכלות מיקרוסקופית ע"י רופא פתולוג מומחה בתחום נותנת לכירורגים אבחנה ראשונית וגבולות כריתה ניתוחיים ובכך לאפשר לכירורגים לבצע המשך ניתוח מושכל יותר.
רשימת צביעות היסטוכימיות שמתבצעות במכון
- Perl's Prussian b-PA
- Masson Trichrome-PA
- Grocott for fung-PA
- Grocott for P.C-PA
- Ziehl neelsen-PA
- Congo Red –PA
- Masson Fontana-PA
- Van Cossa-PA
- Elastic fibers-PA
- Warthin Starry-PA
- Giemsa for HP-PA
- Giemsa Hematholog-PA
- Trichrom-PA
- Mucicarmin-PA
- Reticulin-PA
- PAS-PA
- PAS-Diastase-PA
- Alcian blue-PA
- Crystal Violet