המעבדה לאימונולוגיה קלינית ואלרגיה עוסקת באבחון מגוון רחב של מחלות אוטואימוניות כגון זאבת (SLE), תסמונת שייגרן, סקלרודרמה, שחמת הכבד, צהבת אוטואימונית, וגנר גרנולומטוזיס, וסקוליטיס, מחלת צליאק, מחלות כיליה שונות ועוד.
רשימת הבדיקות כוללת רמות נוגדנים למרכיבי גרעיני התאים ו- dsDNA, מיטוכונדריה, שריר חלק, נוגדנים כנגד תאים פריאטליים, נוגדנים מיקרוסומליים בתירואיד ובכבד, נוגדנים לטירוגלובולין, נוגדנים לפוספוליפידים וממברנות ועוד.
כמו כן מבצעת המעבדה בדיקות של רמות מרכיבי משלים 3 C ו-4 C  ונוגדנים ספציפיים לאלרגנים שונים אצל חולים עם בעיות אלרגיות.

המעבדה נותנת שירות גם לבתי החולים ולקהילה במחוז חפר-שרון–שומרון.

כל העובדים במעבדה בעלי תארים אקדמאים גבוהים. המעבדה מצוידת במכשור מתקדם ביותר, ועומדת בסטנדרטים בינלאומיים תוך השתתפות בתוכניות בקרת-איכות כלל עולמיות.

בנוסף, מתבצעים במעבדה מחקרים ייחודיים בתחומי האלרגיה והאימונולוגיה.