המרכז החינוכי נמצא תחת פיקוח האגף לחינוך מיוחד במשרד החינוך, ופועל לשיפור איכות זמן האשפוז של התלמיד.
המרכז משרת בשנה יותר מ־ 12,000 ילדים בגילים 21-3. המרכז החינוכי לילדים מאושפזים פועל בתשעה מרחבי למידה הפזורים ברחבי בית החולים:
- במרכז סבן לרפואת ילדים - כיתת הנוער, כיתה לגיל הרך, כיתת המדעים והתקשורת, וכיתה במחלקה האונקולוגית
- במכלול הדרומי ליד אשפוז־יום כירורגי - כיתה המיועדת לתלמידים המאושפזים במחלקות עיניים, אף, אוזן וגרון, פלסטיקה ואורתופדית
- במחלקת כירורגיית ילדים
- באשפוז־יום המטואונקולוגית ילדים
במרכז סבן פועל "סינמה סורוקה" - בית קולנוע שבו מוקרנים מדי יום סרטים בשעות הצהריים ואחר הצהריים.
המרכזים משרתים את הילדים המטופלים המגיעים מאזור הנגב וממקומות שונים בארץ.

הלמידה מתקיימת בכיתות הלימוד, ליד מיטותיהם של התלמידים המאושפזים או בחדרי הבידוד, בהתאם לצרכיו ולמגבלותיו של כל תלמיד.
הצוות החינוכי מעניק לכל תלמיד מאושפז ולהוריו מידע על אודות השירותים החינוכיים המוצעים ועל אודות זכויותיו של תלמיד מאושפז.
תפקידי המרכז החינוכי לילדים מאושפזים בסורוקה:
מטרות המרכז החינוכי:
- הענקת האפשרות לכל תלמיד מאושפז, ללמוד על פי צרכיו ומשאלותיו, ובהתאם לתכנית הלימודים של המסגרת החינוכית שבה הוא לומד
- הנעת התלמידים ללמידה במטרה לשמור על הרצף הלימודי שנקטע עקב האשפוז
- סיוע לתלמידים בשימור ובטיפוח כישוריהם ומיומנויותיהם בתחום הקוגניטיבי, הרגשי והחברתי
- טיפוח כישורים אשר יתרמו להם בהתמודדות עם מצבם במהלך האשפוז

- סיוע לתלמידים בשמירה על קשר חברתי ולימודי עם חבריהם ועם המסגרות החינוכיות שלהן הם משתייכים, ואליהן הם עתידים לחזור
- עידוד בני המשפחה של הילדים למעורבות ולשותפות בתהליכים החינוכיים
- הכנת הילדים לקראת חזרתם למסגרות החינוכיות
- סיוע לתלמידים המאושפזים בהתמודדות הרגשית עם חוויית המחלה והאשפוז, והענקת האפשרות לפרוק את מצוקותיהם בעזרת אמצעים חינוכיים
- הענקת האפשרות לחוות חוויות מהנות ומתקנות אשר יקלו על חוויית האשפוז
- פיתוח תחומי עניין ותחביב
מאפיינים פדגוגיים־חינוכיים וארגוניים
- המסגרת החינוכית עובדת במקביל למסגרת הרפואית, שתיהן פועלות בשותפות מלאה
- אוכלוסיית התלמידים היא הטרוגנית - רב־גילית ורב־תרבותית וכוללת תלמידים מהמגזר היהודי והערבי, מהחינוך החילוני והדתי ומהחינוך הרגיל והמיוחד. צוות המורים מחוייב לגמישות רבה ולהיכרות עם תכניות לימודים רבות ועם דרכי הוראה מגוונות
- הלמידה מתבצעת באופן פרטני ובקבוצות
- כיתות הלימוד מהוות סביבות חדשניות, מעוררות עניין, עשירות באמצעים טכנולוגיים, מדעיים ואמנותיים ומאתגרות ללמידה. לרשות התלמיד מגוון רחב של תחומי עניין
- התמיכה החינוכית מתבצעת בשיתוף מלא עם התלמיד והוריו על־פי רצונותיו ומשאלותיו
- התלמיד במרכז: שותף, יוזם ומוביל תהליכי למידה
- המורה מדריך, מלווה, מכוון, מייעץ ומסייע לתלמיד
- בית הספר מתנהל על־פי תכנית פעילות שנתית
- בית הספר פועל על־פי התפיסה ההוליסטית הרואה את בריאות האדם בגופו ובנפשו קשורים יחדיו, גישה המאפשרת שיתוף פעולה בין הצוותים החינוכיים, הרפואיים והסיעודיים