צוות המכון עוסק בבדיקה של תאים ורקמות לצורך אבחון מחלות הבאות לידי ביטוי בשינויים במבנה שלהם:
ביופסיה - כל רקמה שנלקחת מהגוף ונשלחת למכון לפתולוגיה לצורך אבחנה. האבחנה נקבעת לרוב באמצעות הסתכלות במיקרוסקופ אור
- במכון מתבצעות גם בדיקות מתקדמות תוך שימוש בשיטות של ביולוגיה מולקולרית לצורך זיהוי חלבונים מסויימים, קטעי DNA ועוד
- בבדיקת ביופסיות שנלקחו מהכליה ומהשריר נעשה שימוש במיקרוסקופ אלקטרוני ובמיקרוסקופ פלורסצנטי
- במכון מתבצעות בדיקות המתקיימות במקביל למהלכם של ניתוחים. בתוך כ־20 דקות ניתן לתת למנתח תשובה המאשרת קיומו של תהליך גידולי או שוללת אותו
- במכון נבדקות גם דגימות הנלקחות בקהילה, כגון משטח צוואר הרחם (פאפ), ביופסיות מנגעי עור וכדומה
- המכון משתתף בייעוץ גנטי הניתן בעקבות הפלה, לצורך מניעה של הפלות עתידית, יחד עם צוות הכולל גינקולוג מיילדותי, רופא יילודים וגנטיקאי ובשיתוף ההורים לעתיד
תוצאות הבדיקות אינן נמסרות למטופלים. האבחנות הפתולוגיות מודפסות ונשלחות לרופא ששלח את הדגימה. רופאי הכללית יכולים לצפות בתוצאות במערכת האופק הממוחשבת.
מחלקות בית החולים רבות נעזרות בשירותי המכון: הפנימיות, הכירורגיות, נשים, ילדים, עור, המכון לאונקולוגיה, המכון לגסטרואנטרולוגיה ועוד.
אנשי הצוות של המכון לפתולוגיה ואנשי הצוותים הקליניים של המחלקות הנעזרות בשירותי המכון,
עורכים ישיבות משותפות לצורך שיתוף פעולה, להעברת מידע ולהצגת ממצאים.
הפעילות האקדמית והמחקר במכון לפתולוגיה