•  מחלות דרכי העיכול, כבד, מרה ולבלב, על ההיבטים האבחנתיים והטיפולייo של מחלות אלו.
•  אבחון וטיפול בכאבי בטן, שלשולים, עצירות, צרבת, קושי בבליעה, כיב תריסריון, מחלות דלקתיות של המעי, תסמונת המעי הרגיש ומחלות הכבד.
•  ביצוע טיפולים המונעים צורך בניתוח.
•  תוכנית למניעה ולגילוי מוקדם של סרטן המעי הגס, בקרב אוכלוסייה בסיכון מוגבר.
•  מחקר למציאת דרכים למניעה וטיפול במחלות דרכי העיכול והכבד
  מקרים בעיתיים מועלים לדיון בישיבות צוות המתכנסות פעם בשבוע. במקרה של אשפוז עקב מחלה של דרכי העיכול והכבד, ימשיך צוות המכון לעקוב ולטפל בשיתוף מלא עם צוות המחלקה המאשפזת. המכון מבצע פעולות אנדוסקופיות של מערכת העיכול העליונה והתחתונה, הכוללות אבחון וכריתת פוליפים, קשירה והזרקה לדליות בוושט, הוצאת גופים זרים, ERCP, הכנסת תותבים לדרכי מרה, הכנסת תותבים לוושט ולמעי הגס, הוצאת אבנים מדרכי מרה, EUS, ניקור כבד, מנומטריה של הושט ושל פי הטבעת והחלחולת, ניטור חומציות ל- 24 שעות, אלקטרוגסטרוגרפיה (EGG) טיפול ביופידבק לעצירות ולחוסר שליטה על סוגרים. מעבדת גסטרו, הצמודה למכון, מבצעת בדיקות נשיפה, בדיקת לקטוז, תפקודי לבלב, סרולוגיה להליקובקטר פילוריולאכינוקוקוס, לאנליזה כימית של מרה וצואה.

המעבדה פעילה גם במחקר רפואי הקשור למחלות דרכי העיכול והכבד.

מדי שבוע, ולאורך כל השנה, מתקיימות פגישות עדכון סדירות לגבי חידושים בספרות הרפואית, בהן מוצגים סמינריונים ומחקרים בגסטרואנטרולוגיה.

המכון רואה במטופל את מרכז העשייה. רופא אחד מטפל במטופל לכל אורך הדרך ובמידה שיש צורך באשפוז, אותו רופא ימשיך לעקוב אחרי המטופל במחלקת האשפוז.