יחידת הצנתורים במרכז הרפואי קפלן הוקמה בשנת 1989. מאז פתיחתה בוצעו בה יותר מ-36000 צנתורים. ביחידה מבוצעים צינתורים אבחנתיים וצינתורים טיפוליים לאורך עשרים וארבע שעות ביממה, שבעה ימים בשבוע. חלק מהמטופלים מובאים לצנתור בזמן אוטם חריף בשריר הלב ישירות על ידי ניידות לטיפול נמרץ וזוהי עבורם התערבות חירום, שתכליתה הצלת חיים.
מאז הקמתה הוכנסו והוטמעו ביחידה טכנולוגיות חדשות מהמתקדמות בעולם, לאבחון ולטיפול גם יחד.
היחידה נוטלת חלק במספר רב של מחקרים לאומיים ובין-לאומים בטכנולוגיות מתקדמות ובתרופות חדישות. בין האמצעים החדישים הנמצאים כיום בשימוש בחדר הצנתורים, מצויים צנתרים עם אולטרה-סאונד ואמצעים מיוחדים לבדיקת הזרימה בעורקים הכליליים.
בנוסף לצנתורים אבחנתיים מבוצעים ביחידה צנתורים טיפוליים בטכנולוגיות החדישות ביותר. בין אלה ניתן להזכיר פתיחת היצרויות על ידי תומכנים מסוג מתקדם ובאיכות גבוהה ביותר וקידוח בעורקים מסוידים.
בדומה למרכזים גדולים בעולם, בוצעו ביחידה בהצלחה מרובה סגירות של דלף במחיצה הבין עליתיית.
ביחידה הושתלו בשנה האחרונה בפרוצדורה צינתורית מתוחכמת, מסתמים אאורטלים בחולים קשישים אשר ניתוח היווה בעבורם סיכון גדול ביותר. בפעולות אלה משתתף צוות רב-תחומי מיומן ומתואם ובתוך ימים אחדים מתום הפעולה, כל החולים שוחררו לביתם.