במסגרת השירות לכירורגיה של הקולון והרקטום מתבצעים ניתוחים לטיפול במחלות שפירות וממאירות של המעי הגס והרקטום. הניתוחים מבוצעים הן בשיטות ניתוחיות פתוחות והן בשיטות זעיר-פולשניות (לפרוסקופיות).
כמו-כן, מתבצעים ניתוחים לטיפול בבעיות פרוקטולוגיות שונות, רובם במסגרת אמבולטורית באשפוז יום כירורגי.
השירות מפעיל מרפאה פרוקטולוגית ייעודית למתן ייעוץ, אבחון וטיפול בבעיות שכיחות בתחום זה. המרפאות מאוישות על ידי רופאים בכירים שעברו התמחות ספציפית בתחום זה.
השירות עובד בשיתוף פעולה הדוק עם המכון הגסטרואנטרולוגי במרכז הרפואי בראשות ד"ר אהוד מלצר. במכון מתבצעות פעולות אבחוניות וטיפוליות מורכבות בתחום זה הן לקראת הניתוחים והן כמעקב לאחריהם.