המחלקה מאשפזת חולים המופנים דרך חדר מיון או לאחר תיאום עם רופאי המחלקה.
תחום העניין העיקרי של המחלקה הוא אבחון וטיפול במחלות זיהומיות.
המחלקה משמשת מרכז הפנייה וייעוץ בתחום הכולל זיהומים שונים ובעיקר זיהומים מועברים מבעלי חיים
(ZOONOSES) וזיהומים ע''י החיידק הליקובקטר פילורי. 

פעילות אקדמית ומחקרית   
 
המחלקה מסונפת לביה''ס לרפואה ע''ש סאקלר באוניברסיטת תל-אביב. ד''ר סילביו פיטליק וד''ר חיים שמואלי מרצים בכנסים בארץ ובחו"ל בנושאי: אפידמיולוגיה של זיהומים המועברים מבעלי חיים לבני אדם, הליקובקטר פילורי, בקטרמיה וזיהומים במערכת הקרדיוסקולרית.

מחקרים פעילים כעת:
אפידמיולוגיה של זיהומים המועברים מבעלי חיים לבני אדם וזיהומים בחולים מאושפזים בבתי חולים, הקשר בין זיהום בהליקובקטר פילורי לסרטן המעי הגס ולמחלות אחרות. מחקרים קליניים בתרופות אנטיביוטיות חדישות.