המערך לגסטרואנטרולוגיה במרכז הרפואי רבין מטפל בכ-40,000 מטופלים מאושפזים ואמבולטוריים בשנה בבתי החולים בילינסון והשרון ועוסק בטיפול במגוון מחלות דרכי העיכול.
המערך לגסטראנטרולוגיה כולל את המכון בביה''ח בילינסון על יחידות המשנה שלו, ואת היחידה לגסטרואנטרולוגיה בביה''ח השרון.

יחידות המשנה בביה''ח בילינסון הן: מעבדה ארצית ומכון לחקר הליקובקטר פילורי, יחידה לאנדוסקופיה מתקדמת, יחידה למחלות מעי דלקתיות, שירות לתנועתיות מערכת העיכול, שירות למחלות רצפת האגן, מרפאות כלליות לגסטרואנטרולוגיה ויחידה מיוחדת לגילוי מוקדם של סרטן המעי הגס.
במכון ניתנים ייעוצים למטופלים אמבולטוריים ולמאושפזים, כמו כן נעשות פעולות אנדוסקופיות מתקדמות לאבחון ולטיפול במחלות המעי הגס, הוושט, הקיבה והמעי הדק. המערך לגסטרואנטרולוגיה הוא חלק מהמרחב המקצועי המשותף למרכז הרפואי רבין ולמחוז דן-פ"ת של שירותי בריאות כללית וכולל גם את היחידה לגסטרואנטרולוגיה "קונקורד".

הפרוצדורות המבוצעות במערך לגסטרואנטרולוגיה הן:
גסטרוסקופיה
קולונוסקופיה
סיגמואידוסקופיה
החדרת צינור האכלה לקיבה (PEG)
הדמיה של דרכי המרה והלבלב (ERCP ו- US אנדוסקופי רדיאלי וליניארי)
אנדוסקופיה של המעי הדק (אנטרוסקופיה)
ווידאו קפסולה של המעי הדק
מנומטריה של הוושט
מנומטריה של פי הטבעת
הדמיה של פעולת הצאיה (דפקוגרפיה)
אולטרה סאונד של הרקטום - TRUS
ניטור חומציות בוושט
תבחין נשיפה ללקטוז
תבחין נשיפה להליקובקטר פילורי
הערכת קצב הפרשת חומצת הקיבה
תבחין התרוקנות הקיבה
זמן מעבר במערכת העיכול

פעילות אקדמית ומחקרית   
במערך פועלת מעבדת מחקר העוסקת בסרטן המעי הגס, השינויים הגנטיים והמולקולאריים החלים ברקמת הגידול והקשר עם הווירוס JCV, מעבר יונים במעי והפרשת מוצינים ע''י הקיבה והמעי הגס. מתבצעים מחקרים על החיידק הליקובקטר פילורי ומחקרים קליניים לבדיקת יעילותן של תרופות חדשות לטיפול במחלות מעי דלקתיות ומניעת חזרת פוליפים במעי הגס.